24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3642 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3642  putative biofilm stress and motility protein A  100 
 
 		 103 aa  209  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3787  putative biofilm stress and motility protein A  100 
 
 		 103 aa  209  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0686  putative lipoprotein  98.11 
 
 		 53 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0443  putative biofilm stress and motility protein A  58.14 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468468 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0368  putative biofilm stress and motility protein A  50 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.883495  normal  0.028319 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4660  putative biofilm stress and motility protein A  43.52 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4433  putative biofilm stress and motility protein A  43.52 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4749  putative biofilm stress and motility protein A  43.52 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4719  putative biofilm stress and motility protein A  43.52 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4657  putative biofilm stress and motility protein A  45.92 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4647  putative biofilm stress and motility protein A  45.92 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4797  putative biofilm stress and motility protein A  45.92 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5705  putative biofilm stress and motility protein A  42.59 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3440  putative biofilm stress and motility protein A  48.57 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.259857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4740  putative biofilm stress and motility protein A  44.9 
 
 		 100 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.613855  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3804  protein of unknown function DUF1471  43.52 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04018  hypothetical protein  43.52 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04056  hypothetical protein  43.52 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3824  putative biofilm stress and motility protein A  42.59 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4776  putative biofilm stress and motility protein A  45.92 
 
 		 100 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0771  putative biofilm stress and motility protein A  37.14 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0137672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0791  putative biofilm stress and motility protein A  45.07 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0442  hypothetical protein  30.11 
 
 		 91 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836978  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0367  hypothetical protein  35.71 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>