33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2425 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2425  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  294  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2523  hypothetical protein  99.31 
 
 
178 aa  293  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.403665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3077  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  275  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1513  hypothetical protein  83.33 
 
 
60 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3619  hypothetical protein  91.43 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3168  hypothetical protein  96.77 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3968  hypothetical protein  91.43 
 
 
37 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.253252  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0934  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2271  hypothetical protein  100 
 
 
41 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2034  hypothetical protein  100 
 
 
41 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0908  hypothetical protein  96.77 
 
 
38 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0310  putative periplasmic protein  35.9 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1362  hypothetical protein  37.08 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0304  hypothetical protein  35.85 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.025382  normal  0.0547259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0316  hypothetical protein  35.85 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220539  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3721  hypothetical protein  90 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0976178  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4014  hypothetical protein  86.21 
 
 
44 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1617  hypothetical protein  79.41 
 
 
37 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.965967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3548  hypothetical protein  92.31 
 
 
48 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.723446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1112  hypothetical protein  73.53 
 
 
54 aa  48.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3820  hypothetical protein  85.71 
 
 
37 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.735422  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2373  hypothetical protein  100 
 
 
33 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1867  hypothetical protein  100 
 
 
53 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.316635  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3789  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2137  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3030  hypothetical protein  95.65 
 
 
46 aa  47.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2062  hypothetical protein  100 
 
 
45 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1755  hypothetical protein  76.47 
 
 
37 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000732722 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0246  hypothetical protein  100 
 
 
34 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4005  hypothetical protein  95.45 
 
 
51 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4346  hypothetical protein  31.18 
 
 
114 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4041  hypothetical protein  29.03 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222851  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3645  hypothetical protein  59.46 
 
 
37 aa  40  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>