24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1539 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1724  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  691    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00581196  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1648  CRISPR-associated Csy3 family protein  99.7 
 
 		 334 aa  690    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1539  CRISPR-associated protein, Csy3 family  100 
 
 		 334 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3655  CRISPR-associated protein, Csy3 family  74.63 
 
 		 337 aa  522  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0700  CRISPR-associated protein, Csy3 family  73.37 
 
 		 335 aa  518  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0730  CRISPR-associated protein, Csy3 family  69.32 
 
 		 336 aa  484  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1405  CRISPR-associated Csy3 family protein  69.35 
 
 		 332 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3237  CRISPR-associated Csy3 family protein  61.14 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3373  CRISPR-associated Csy3 family protein  61.14 
 
 		 327 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.231697  hitchhiker  0.0075039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33310  hypothetical protein  60.58 
 
 		 342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161502  normal  0.0804906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0485  CRISPR-associated Csy3 family protein  59.17 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0328315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1215  CRISPR-associated Csy3 family protein  59.82 
 
 		 342 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2451  CRISPR-associated protein, Csy3 family  56.77 
 
 		 346 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1456  CRISPR-associated Csy3 family protein  59.1 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00737241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1101  hypothetical cytosolic protein  54.6 
 
 		 353 aa  350  1e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.325642  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1399  CRISPR-associated Csy3 family protein  50.45 
 
 		 341 aa  341  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.829884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2841  hypothetical protein  49.85 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0048  hypothetical protein  49.85 
 
 		 341 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1946  hypothetical cytosolic protein  47.54 
 
 		 369 aa  315  6e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0252  CRISPR-associated Csy3 family protein  47.25 
 
 		 356 aa  311  9e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2754  hypothetical protein  38.2 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06213  hypothetical protein  27.09 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3853  CRISPR-associated Csy3 family protein  28.72 
 
 		 349 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4185  CRISPR-associated protein, Csy3 family  27.09 
 
 		 349 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>