23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3114 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3114  GP46 family protein  100 
 
 		 145 aa  290  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1472  phage protein GP46  68.67 
 
 		 151 aa  213  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2812  GP46 family protein  68.67 
 
 		 151 aa  213  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2734  phage protein GP46  68.67 
 
 		 151 aa  210  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.86914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2085  phage protein GP46  57.04 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3048  putative bacteriophage protein GP46, Mu-like  50.69 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162081 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1871  GP46 family protein  49.21 
 
 		 405 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881976  hitchhiker  0.000000000000640584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3734  phage GP46  50 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1045  phage protein GP46  43.88 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0695  phage protein GP46  40.52 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0742  phage protein GP46  40.52 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3861  phage FluMu protein gp46  39.83 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2701  hypothetical protein  53.57 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1161  Phage FluMu protein gp46  52.08 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4588  Phage GP46  51.61 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2445  hypothetical protein  32.82 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2585  phage GP46 family protein  38.26 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2252  phage protein GP46  43.68 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2249  phage protein GP46  43.68 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4480  phage protein GP46  43.68 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4483  GP46 family protein  35.9 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.185083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6584  putative bacteriophage protein, GP46-like protein  31.91 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0186  hypothetical protein  40.98 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>