22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2812 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2812  GP46 family protein  100 
 
 		 151 aa  300  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1472  phage protein GP46  100 
 
 		 151 aa  300  6.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2734  phage protein GP46  99.34 
 
 		 151 aa  296  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.86914  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3114  GP46 family protein  68.67 
 
 		 145 aa  191  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2085  phage protein GP46  53.02 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3048  putative bacteriophage protein GP46, Mu-like  45.7 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3734  phage GP46  46.58 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1871  GP46 family protein  46.21 
 
 		 405 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881976  hitchhiker  0.000000000000640584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1045  phage protein GP46  43.85 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0695  phage protein GP46  37.31 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0742  phage protein GP46  37.31 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2701  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2252  phage protein GP46  42.31 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2249  phage protein GP46  38.1 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4480  phage protein GP46  38.1 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4588  Phage GP46  52.04 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3861  phage FluMu protein gp46  45.92 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1161  Phage FluMu protein gp46  55.95 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2585  phage GP46 family protein  34.81 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2445  hypothetical protein  33.93 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4483  GP46 family protein  36.21 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.185083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6584  putative bacteriophage protein, GP46-like protein  33.33 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>