18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0931 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0931  putative bacteriophage protein  100 
 
 
207 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678371  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0913  phage-like protein  64.56 
 
 
211 aa  289  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2784  phage protein  55.62 
 
 
195 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3475  phage protein  55.62 
 
 
195 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2919  phage protein  55.62 
 
 
195 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0894575  hitchhiker  0.000000000302279 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1044  hypothetical protein, putative phage gene  47.46 
 
 
196 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0686  hypothetical protein  48.17 
 
 
174 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5070  hypothetical protein  48.17 
 
 
174 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1038  hypothetical protein  40.28 
 
 
219 aa  168  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4007  hypothetical protein  46.95 
 
 
174 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0715  putative bacteriophage protein  45.88 
 
 
176 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.851836  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0571  hypothetical protein  47.68 
 
 
240 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809669  normal  0.240365 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1452  hypothetical protein  36.61 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.324561  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2749  hypothetical protein  36.61 
 
 
203 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.815887  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0256  hypothetical protein  44.29 
 
 
204 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05043  hypothetical protein  42.95 
 
 
166 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0739  hypothetical protein  33.14 
 
 
212 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1301  hypothetical protein  29.73 
 
 
210 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>