18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0913 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0913  phage-like protein  100 
 
 
211 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0931  putative bacteriophage protein  64.56 
 
 
207 aa  289  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678371  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2784  phage protein  58.01 
 
 
195 aa  228  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2919  phage protein  58.01 
 
 
195 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0894575  hitchhiker  0.000000000302279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3475  phage protein  57.46 
 
 
195 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0686  hypothetical protein  45.98 
 
 
174 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5070  hypothetical protein  45.98 
 
 
174 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4007  hypothetical protein  44.25 
 
 
174 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1038  hypothetical protein  45.71 
 
 
219 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1044  hypothetical protein, putative phage gene  47.02 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0571  hypothetical protein  48.67 
 
 
240 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809669  normal  0.240365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0715  putative bacteriophage protein  45.89 
 
 
176 aa  141  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.851836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1452  hypothetical protein  36.87 
 
 
203 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.324561  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2749  hypothetical protein  36.87 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.815887  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0256  hypothetical protein  39.1 
 
 
204 aa  124  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05043  hypothetical protein  36.97 
 
 
166 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0739  hypothetical protein  31.4 
 
 
212 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.105419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1301  hypothetical protein  29.7 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>