27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1127 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  99.69 
 
 		 319 aa  643    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  646    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  59.68 
 
 		 335 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  51.58 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  31.83 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  33.98 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  32.7 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  33.98 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  33.59 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  31.9 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  29.48 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  32.44 
 
 		 456 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  35.64 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  31.66 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  32.68 
 
 		 349 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  32.52 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  34.5 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  33.82 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29.86 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  28.35 
 
 		 779 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  34.1 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  27.45 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  28.1 
 
 		 366 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  28.19 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0656  hypothetical protein  21.31 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  23.05 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  24.09 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>