27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1093 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  646    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  99.69 
 
 
319 aa  643    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  59.68 
 
 
335 aa  340  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  51.58 
 
 
321 aa  298  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  32.15 
 
 
328 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  33.98 
 
 
374 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  33.98 
 
 
369 aa  122  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  32.17 
 
 
335 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  33.59 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  31.9 
 
 
318 aa  113  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  30.91 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  32.44 
 
 
456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  31.66 
 
 
334 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  35.64 
 
 
324 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  32.68 
 
 
349 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  32.52 
 
 
339 aa  94  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  34.5 
 
 
323 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  33.82 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29.86 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  29.53 
 
 
779 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  32.56 
 
 
395 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  27.45 
 
 
327 aa  55.8  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  28.23 
 
 
366 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  28.19 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0656  hypothetical protein  21.31 
 
 
298 aa  47  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  24.09 
 
 
323 aa  45.8  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  23.05 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>