19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2547 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2547  hypothetical protein  100 
 
 
538 aa  996    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278344  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09080  hypothetical protein  37.82 
 
 
574 aa  206  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.975766  normal  0.391282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2345  hypothetical protein  38.11 
 
 
507 aa  197  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.274272  hitchhiker  0.00000585461 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1208  hypothetical protein  39.36 
 
 
528 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1859  hypothetical protein  33.15 
 
 
623 aa  151  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.163853  normal  0.0142355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1194  hypothetical protein  36.15 
 
 
577 aa  150  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1265  hypothetical protein  34.59 
 
 
558 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000106204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20770  hypothetical protein  32.23 
 
 
560 aa  115  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0250367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2513  hypothetical protein  35.84 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0461  hypothetical protein  32.48 
 
 
513 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.274744  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1384  hypothetical protein  31.87 
 
 
471 aa  64.3  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0753  hypothetical protein  28.05 
 
 
489 aa  63.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0387662 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0759  hypothetical protein  24.26 
 
 
513 aa  63.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.13019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4066  hypothetical protein  30.5 
 
 
601 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7607  hypothetical protein  31.41 
 
 
582 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1413  hypothetical protein  28.97 
 
 
475 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0668579  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0591  hypothetical protein  20.7 
 
 
528 aa  50.1  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.373407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3763  hypothetical protein  33.85 
 
 
582 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0747  hypothetical protein  30.85 
 
 
472 aa  43.5  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>