22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1057 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1057  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1322  Domain of unknown function DUF2017  42.28 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.134617  hitchhiker  0.00216166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2584  hypothetical protein  32.56 
 
 
188 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0884  hypothetical protein  35.47 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2316  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2740  hypothetical protein  35.94 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25080  hypothetical protein  36.81 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20080  protein of unknown function (DUF2017)  31.08 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0919227  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1690  hypothetical protein  35.04 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0379903  hitchhiker  0.00000515175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1491  hypothetical protein  36.26 
 
 
184 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2371  hypothetical protein  31.03 
 
 
182 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1308  hypothetical protein  29.5 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1695  hypothetical protein  30.99 
 
 
181 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185996  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0935  hypothetical protein  30.22 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  0.761399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1099  hypothetical protein  31.29 
 
 
164 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.623925  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0988  hypothetical protein  28.64 
 
 
166 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278461  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3765  hypothetical protein  29.02 
 
 
198 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5655  hypothetical protein  34.59 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3874  hypothetical protein  30.66 
 
 
175 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08340  hypothetical protein  34.91 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29220  protein of unknown function (DUF2017)  29.27 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.942758  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10710  hypothetical protein  31 
 
 
254 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0355904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>