14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4923 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4923  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2884  hypothetical protein  48.51 
 
 
202 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.218946  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0327  hypothetical protein  46.53 
 
 
202 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2068  hypothetical protein  46.53 
 
 
202 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38348  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3468  hypothetical protein  39 
 
 
198 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.671623  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3317  hypothetical protein  40.3 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2903  hypothetical protein  40.31 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3582  hypothetical protein  43.14 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1408  hypothetical protein  29.35 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  0.630193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0328  hypothetical protein  28.5 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2067  hypothetical protein  28.5 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0220632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2536  hypothetical protein  20.79 
 
 
198 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0484  hypothetical protein  24.46 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.173769 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4924  hypothetical protein  23.74 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>