24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4582 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4582  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890687  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0574  hypothetical protein  92.31 
 
 
66 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0658365  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4022  hypothetical protein  94.55 
 
 
55 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654387  normal  0.0665825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3068  hypothetical protein  79.25 
 
 
55 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3023  hypothetical protein  75.93 
 
 
55 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  63.93 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1538  hypothetical protein  62.12 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0327376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3522  hypothetical protein  68.52 
 
 
55 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1213  hypothetical protein  68.52 
 
 
55 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0531  hypothetical protein  69.81 
 
 
54 aa  70.5  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248706  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3155  hypothetical protein  66.67 
 
 
57 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  55.56 
 
 
55 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  56.25 
 
 
52 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2499  hypothetical protein  47.37 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.421423  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3834  hypothetical protein  50.91 
 
 
57 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100486  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  50.94 
 
 
54 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  48.98 
 
 
56 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0726  hypothetical protein  59.26 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509331  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9156  Helicase subunit of the DNA excision repair complex  45.1 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5552  hypothetical protein  45.83 
 
 
56 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.423548  normal  0.0424308 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0261  hypothetical protein  45.1 
 
 
58 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4310  hypothetical protein  34.69 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0646462  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4469  hypothetical protein  42.86 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4969  hypothetical protein  44.68 
 
 
60 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553476  normal  0.926991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>