17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4483 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4483  GP46 family protein  100 
 
 
150 aa  288  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.185083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3048  putative bacteriophage protein GP46, Mu-like  40 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162081 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1871  GP46 family protein  39.1 
 
 
405 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881976  hitchhiker  0.000000000000640584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3734  phage GP46  37.78 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1472  phage protein GP46  36.21 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2812  GP46 family protein  36.21 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2734  phage protein GP46  36.21 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.86914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1045  phage protein GP46  33.82 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2085  phage protein GP46  36.21 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3114  GP46 family protein  40.7 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2701  hypothetical protein  38.1 
 
 
151 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0695  phage protein GP46  35.87 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0742  phage protein GP46  35.87 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1161  Phage FluMu protein gp46  39.73 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2249  phage protein GP46  33.33 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4480  phage protein GP46  33.33 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2252  phage protein GP46  33.33 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>