25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4022 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4022  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654387  normal  0.0665825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4582  hypothetical protein  94.55 
 
 		 66 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890687  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0574  hypothetical protein  92.59 
 
 		 66 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0658365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3068  hypothetical protein  77.36 
 
 		 55 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3023  hypothetical protein  74.07 
 
 		 55 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  74.07 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3522  hypothetical protein  66.67 
 
 		 55 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1213  hypothetical protein  66.67 
 
 		 55 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0531  hypothetical protein  67.92 
 
 		 54 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248706  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1538  hypothetical protein  62.96 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0327376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  55.56 
 
 		 55 aa  60.1  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  50.94 
 
 		 54 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  54.17 
 
 		 52 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3834  hypothetical protein  51.85 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100486  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2499  hypothetical protein  49.09 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.421423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  48.98 
 
 		 56 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9156  Helicase subunit of the DNA excision repair complex  47.06 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0726  hypothetical protein  59.26 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509331  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5552  hypothetical protein  45.83 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.423548  normal  0.0424308 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0261  hypothetical protein  43.14 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3155  hypothetical protein  69.7 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245214  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4469  hypothetical protein  40.82 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4969  hypothetical protein  42.55 
 
 		 60 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553476  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4310  hypothetical protein  35.42 
 
 		 62 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0646462  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4969  hypothetical protein  44.9 
 
 		 54 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.689573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>