29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3794 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3794  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3545  hypothetical protein  38.21 
 
 
288 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3312  hypothetical protein  37.46 
 
 
290 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0618924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4750  hypothetical protein  40.14 
 
 
285 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.838034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2446  hypothetical protein  36.72 
 
 
296 aa  178  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.33058  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2409  hypothetical protein  35.58 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1428  hypothetical protein  36.44 
 
 
295 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1346  hypothetical protein  36.84 
 
 
302 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3042  hypothetical protein  35.58 
 
 
273 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5187  hypothetical protein  35.48 
 
 
288 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4720  hypothetical protein  35.48 
 
 
288 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7421  hypothetical protein  35.69 
 
 
284 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6683  hypothetical protein  34.88 
 
 
285 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5259  protein of unknown function DUF1849  35.71 
 
 
293 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245499  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1867  hypothetical protein  35.1 
 
 
299 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1791  hypothetical protein  34.69 
 
 
302 aa  145  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.294448  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2529  hypothetical protein  32.58 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1124  hypothetical protein  34.66 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1775  hypothetical protein  34.3 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1578  hypothetical protein  34.3 
 
 
278 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767865  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1121  hypothetical protein  29.5 
 
 
280 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.619187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1164  hypothetical protein  29.5 
 
 
280 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2028  hypothetical protein  29.09 
 
 
279 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0094929  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0582  hypothetical protein  26.1 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1380  hypothetical protein  29.32 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2808  hypothetical protein  26.02 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  0.727732 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0449  Domain of unknown function DUF1849  25.4 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0157  hypothetical protein  25.68 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2069  hypothetical protein  25.87 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>