16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3312 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3312  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  248  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0562  hypothetical protein  34.92 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0563  hypothetical protein  34.92 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2694  hypothetical protein  32.06 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1935  hypothetical protein  32.09 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2931  hypothetical protein  31.54 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.272823  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4925  hypothetical protein  32.03 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.229271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3530  hypothetical protein  29.85 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.299759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4209  hypothetical protein  30.53 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4722  hypothetical protein  29.01 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160969  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4416  hypothetical protein  28.91 
 
 
128 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661813  normal  0.635789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4879  hypothetical protein  28.91 
 
 
128 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.495712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0579  hypothetical protein  25.95 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0715642  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1767  hypothetical protein  25 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1666  hypothetical protein  32.54 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.366873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2046  hypothetical protein  29.77 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>