20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3023 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3023  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3068  hypothetical protein  90.91 
 
 
55 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1213  hypothetical protein  84.91 
 
 
55 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3522  hypothetical protein  84.91 
 
 
55 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  75.47 
 
 
93 aa  86.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0574  hypothetical protein  77.78 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0658365  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4022  hypothetical protein  74.07 
 
 
55 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654387  normal  0.0665825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4582  hypothetical protein  75.93 
 
 
66 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890687  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0531  hypothetical protein  67.92 
 
 
54 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248706  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1538  hypothetical protein  60.38 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0327376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3834  hypothetical protein  53.7 
 
 
57 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  54.72 
 
 
55 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  49.06 
 
 
52 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  43.4 
 
 
54 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0261  hypothetical protein  48 
 
 
58 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3155  hypothetical protein  72.73 
 
 
57 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0726  hypothetical protein  56.6 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509331  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4469  hypothetical protein  46 
 
 
58 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2499  hypothetical protein  39.62 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.421423  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  42.55 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>