16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0105 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0105  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5910  hypothetical protein  70.77 
 
 
202 aa  284  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8911  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1428  hypothetical protein  54.08 
 
 
196 aa  226  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3649  hypothetical protein  57.65 
 
 
196 aa  224  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2347  hypothetical protein  55.15 
 
 
202 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.80228  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1463  hypothetical protein  55.96 
 
 
202 aa  214  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0411  hypothetical protein  50.52 
 
 
196 aa  204  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.515646  normal  0.176286 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7752  hypothetical protein  50.78 
 
 
275 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384713  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7807  hypothetical protein  50.78 
 
 
275 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1228  hypothetical protein  43.81 
 
 
197 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1510  hypothetical protein  43.81 
 
 
197 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0590557  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1889  hypothetical protein  39.78 
 
 
176 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.887435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1785  hypothetical protein  35.71 
 
 
176 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1175  hypothetical protein  31.89 
 
 
179 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0077  hypothetical protein  32.22 
 
 
179 aa  99  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.541745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1419  hypothetical protein  23.57 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>