20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1820 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1820  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  721    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2035  MxaL protein, putative  37.59 
 
 
342 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0480  von Willebrand factor type A  32.69 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4028  putative MxaL-like protein  34.16 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17942  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0788  MxaL protein, putative  36.67 
 
 
323 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.169917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1916  von Willebrand factor, type A  40.74 
 
 
322 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1530  MxaL protein, putative  35.71 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.766517  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4141  von Willebrand factor type A  37.8 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4509  von Willebrand factor type A  37.4 
 
 
331 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.720482 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8031  von Willebrand factor type A  39.2 
 
 
334 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4623  von Willebrand factor type A  36.99 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22995  normal  0.878919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2416  putative MxaL-like protein  36.49 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345255  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3273  MxaL protein, putative  40.91 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3052  MxaL protein, putative  31 
 
 
332 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4201  von Willebrand factor type A  36.4 
 
 
351 aa  126  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564539  normal  0.475934 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0692  von Willebrand factor, type A  27.48 
 
 
324 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1891  MxaL protein, putative  34.92 
 
 
353 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0479077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3806  putative MxaL-like protein  35.06 
 
 
320 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3002  von Willebrand factor, type A  36.96 
 
 
267 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120219  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1900  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.523701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>