24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1456 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1456  CRISPR-associated Csy3 family protein  100 
 
 
340 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00737241  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1215  CRISPR-associated Csy3 family protein  76.45 
 
 
342 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0485  CRISPR-associated Csy3 family protein  76.09 
 
 
341 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0328315 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2451  CRISPR-associated protein, Csy3 family  66.77 
 
 
346 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33310  hypothetical protein  68.24 
 
 
342 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161502  normal  0.0804906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1539  CRISPR-associated protein, Csy3 family  59.1 
 
 
334 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1648  CRISPR-associated Csy3 family protein  58.81 
 
 
334 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1724  hypothetical protein  59.1 
 
 
334 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00581196  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3655  CRISPR-associated protein, Csy3 family  60.12 
 
 
337 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1101  hypothetical cytosolic protein  56.23 
 
 
353 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.325642  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0700  CRISPR-associated protein, Csy3 family  57.52 
 
 
335 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1405  CRISPR-associated Csy3 family protein  56.68 
 
 
332 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1399  CRISPR-associated Csy3 family protein  53.78 
 
 
341 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.829884  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0048  hypothetical protein  52.77 
 
 
341 aa  352  4e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2841  hypothetical protein  52.48 
 
 
341 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3373  CRISPR-associated Csy3 family protein  54.46 
 
 
327 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.231697  hitchhiker  0.0075039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3237  CRISPR-associated Csy3 family protein  54.46 
 
 
327 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0730  CRISPR-associated protein, Csy3 family  54.41 
 
 
336 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202899  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1946  hypothetical cytosolic protein  49.71 
 
 
369 aa  328  9e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0252  CRISPR-associated Csy3 family protein  48.84 
 
 
356 aa  322  8e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2754  hypothetical protein  41.57 
 
 
357 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06213  hypothetical protein  27.73 
 
 
352 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3853  CRISPR-associated Csy3 family protein  25.56 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4185  CRISPR-associated protein, Csy3 family  25.84 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>