11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0424 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0424  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  273  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504457  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4705  transposase (IS4)  77.36 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4881  transposase, IS4 family protein  77.36 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4297  transposase, IS4 family protein  77.36 
 
 
245 aa  82  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0128  transposase, IS4 family protein  71.93 
 
 
285 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0728  transposase (IS4)  52 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0027  transposase IS4 family protein  36.76 
 
 
381 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2703  transposase IS4 family protein  36.76 
 
 
381 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2901  transposase IS4 family protein  36.76 
 
 
381 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.180142  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0712  transposase (IS4)  66.67 
 
 
106 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.590119  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2609  transposase (IS4)  72.41 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.338204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>