18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3546 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3546  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0703945  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6474  hypothetical protein  59.3 
 
 		 86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5182  hypothetical protein  67.9 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870922  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3192  hypothetical protein  37.21 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  40.21 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  35.96 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  42.68 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  34.94 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  34.09 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5917  hypothetical protein  39.02 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  34.09 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  32.95 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  31.87 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0406  hypothetical protein  35.9 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3283  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114531  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  30.68 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  29.67 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  29.55 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>