13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2714 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2714  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  323  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2832  hypothetical protein  59.88 
 
 		 191 aa  193  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1991  hypothetical protein  55.76 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1807  hypothetical protein  55.24 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3970  hypothetical protein  57.45 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.730732  normal  0.0840614 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3044  hypothetical protein  36.23 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0786662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3559  hypothetical protein  40.91 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0668  hypothetical protein  34.06 
 
 		 179 aa  94  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1142  hypothetical protein  32.09 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1164  hypothetical protein  32.09 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0789  hypothetical protein  28 
 
 		 171 aa  84  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0732  hypothetical protein  26.95 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0719  hypothetical protein  26.95 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>