15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1318 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1318  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1654  hypothetical protein  52.54 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1230  hypothetical protein  46.43 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.828135  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0998  hypothetical protein  46.43 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0047  hypothetical protein  44.64 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000988351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3561  hypothetical protein  46.55 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.479395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3902  hypothetical protein  40.74 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.605655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3240  hypothetical protein  37.29 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1603  hypothetical protein  41.38 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0234171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3771  hypothetical protein  39.29 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.756497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4010  hypothetical protein  37.29 
 
 		 60 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.645208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4096  hypothetical protein  37.29 
 
 		 60 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1832  hypothetical protein  52.38 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3718  hypothetical protein  37.93 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.502497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3193  hypothetical protein  37.93 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>