14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0603 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0603  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  361  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2224  hypothetical protein  33.6 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.2113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0976  hypothetical protein  33.6 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2364  hypothetical protein  33.87 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2324  hypothetical protein  33.67 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600501  hitchhiker  0.00000222052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4488  hypothetical protein  33.88 
 
 		 120 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4160  hypothetical protein  32.69 
 
 		 135 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1291  hypothetical protein  32.63 
 
 		 135 aa  48.9  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.777474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59500  hypothetical protein  32.23 
 
 		 120 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000347394  hitchhiker  4.99905e-17 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1425  hypothetical protein  30.3 
 
 		 135 aa  48.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  0.484235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0545  hypothetical protein  31.73 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2833  hypothetical protein  36.08 
 
 		 126 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0899389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1206  hypothetical protein  31.63 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3938  hypothetical protein  30.89 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>