20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0121 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0121  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  216  7.999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06747  hypothetical protein  72.12 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000838  hypothetical protein  71.29 
 
 		 106 aa  147  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3597  hypothetical protein  30.48 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.879973  normal  0.208476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.173269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1953  hypothetical protein  30.77 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0717827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2117  hypothetical protein  30.69 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178867  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3799  hypothetical protein  31.68 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.830774  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3925  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2392  hypothetical protein  32.61 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0467804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2143  hypothetical protein  31.11 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1970  hypothetical protein  32.95 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0349514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2092  hypothetical protein  31.82 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2854  hypothetical protein  30.49 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2043  hypothetical protein  26.67 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33580  hypothetical protein  29.27 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312917  normal  0.0307116 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1562  hypothetical protein  33.77 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00388026  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1552  hypothetical protein  28.89 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0311894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2054  hypothetical protein  27.1 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.95 
 
 		 430 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>