23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2343 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2343  polar flagellar FlgN, putative chaperone  100 
 
 
142 aa  285  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.312185  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1797  hypothetical protein  60.87 
 
 
143 aa  159  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004178  flagellar biosynthesis protein FlgN  51.45 
 
 
141 aa  141  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01279  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway chaperone  50.72 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2323  flagellar biosynthetic protein FlgN  35.04 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.697168  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1298  FlgN  33.33 
 
 
141 aa  77  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3092  FlgN family protein  33.8 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1335  FlgN family protein  31.16 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1411  FlgN family protein  28.99 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1156  FlgN family protein  28.26 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2952  FlgN family protein  28.26 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.409825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2967  FlgN family protein  28.26 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1340  FlgN family protein  29.71 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2602  FlgN family protein  28.99 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.813191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3105  FlgN family protein  28.26 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1316  FlgN family protein  28.26 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1324  FlgN family protein  27.54 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1254  FlgN family protein  27.54 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3255  flagellar biosynthetic protein FlgN  27.54 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1592  FlgN family protein  28.99 
 
 
141 aa  60.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.89295  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1471  putative flagellar protein FlgN  26.09 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02935  putative flagellar protein FlgN  31.3 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3105  FlgN  25.22 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>