20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0225 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0225  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  196  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00343  hypothetical protein  52.69 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002093  aminopeptidase N  51.61 
 
 
101 aa  110  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2577  hypothetical protein  47.92 
 
 
99 aa  97.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00169793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3323  hypothetical protein  42.47 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0047643  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0398  hypothetical protein  37.66 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.980597  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3658  hypothetical protein  42.47 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0283  hypothetical protein  39.73 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000469346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0331  hypothetical protein  36.99 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3644  hypothetical protein  36.99 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.375921  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3840  hypothetical protein  36.99 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4062  hypothetical protein  38.36 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.129489  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4037  hypothetical protein  38.36 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0300  hypothetical protein  36.99 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70675  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4155  hypothetical protein  38.36 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3960  hypothetical protein  38.36 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0263  hypothetical protein  35.62 
 
 
101 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151206  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4195  hypothetical protein  32.58 
 
 
97 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.10678  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0309  hypothetical protein  34.72 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0408  hypothetical protein  35.62 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.392247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>