23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02276 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02276  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  135  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003495  hypothetical protein  96.97 
 
 
66 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1121  hypothetical protein  65.15 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4227  formate dehydrogenase region TAT target  51.72 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4139  hypothetical protein  51.72 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0230  formate dehydrogenase region TAT target  51.72 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3919  hypothetical protein  51.72 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.768927 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3794  twin-arginine translocation pathway signal  51.72 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4109  formate dehydrogenase region TAT target  51.72 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3723  twin-arginine translocation pathway signal  51.72 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1452  hypothetical protein  50.79 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4134  formate dehydrogenase region TAT target  44.62 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0334  twin-arginine translocation pathway signal  48.28 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4130  formate dehydrogenase region TAT target  45.59 
 
 
65 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0062  hypothetical protein  44.12 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3790  twin-arginine translocation pathway signal  48.21 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.973838  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4418  hypothetical protein  40.3 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4810  formate dehydrogenase region TAT target  38.81 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3719  twin-arginine translocation pathway signal  48.21 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3915  hypothetical protein  48.21 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4508  hypothetical protein  48.21 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3610  hypothetical protein  40.35 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0338  hypothetical protein  48.21 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>