22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01279 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01279  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway chaperone  100 
 
 
141 aa  286  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004178  flagellar biosynthesis protein FlgN  91.49 
 
 
141 aa  264  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1797  hypothetical protein  65.25 
 
 
143 aa  194  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2343  polar flagellar FlgN, putative chaperone  50.72 
 
 
142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.312185  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1156  FlgN family protein  33.87 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1298  FlgN  32.62 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1335  FlgN family protein  34.04 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1340  FlgN family protein  29.08 
 
 
141 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3092  FlgN family protein  31.21 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2602  FlgN family protein  29.08 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.813191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3105  FlgN family protein  29.08 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1411  FlgN family protein  29.08 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2323  flagellar biosynthetic protein FlgN  33.64 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.697168  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2952  FlgN family protein  29.08 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.409825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2967  FlgN family protein  29.08 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3255  flagellar biosynthetic protein FlgN  27.66 
 
 
141 aa  60.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1592  FlgN family protein  33.33 
 
 
141 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.89295  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1324  FlgN family protein  26.95 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1254  FlgN family protein  26.95 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1316  FlgN family protein  26.24 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02935  putative flagellar protein FlgN  28.15 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493772  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1471  putative flagellar protein FlgN  29.59 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>