68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004218 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  87.22 
 
 		 185 aa  327  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  58.54 
 
 		 213 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  59.52 
 
 		 210 aa  209  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  48.1 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  48.03 
 
 		 164 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  48.03 
 
 		 164 aa  141  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  46.05 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  45.81 
 
 		 169 aa  134  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  43.31 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  43.31 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  43.31 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  43.31 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  42.04 
 
 		 164 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  42.04 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  42.04 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  42.67 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  42.14 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  42.28 
 
 		 184 aa  128  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  44.44 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  38.1 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  38.69 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  42.31 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  41.18 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  37.91 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  40.82 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  40.82 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  40.82 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1175  LPS-assembly lipoprotein RlpB  36.08 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.88 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.88 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.88 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.88 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.88 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  39.74 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0610  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.29 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00711824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0661  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.29 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0730  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.29 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00599  hypothetical protein  39.29 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2985  Rare lipoprotein B  39.29 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0667  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.29 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000932859  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0693  LPS-assembly lipoprotein RlpB  39.29 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00387404  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00610  minor lipoprotein  39.29 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0274387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3004  LPS-assembly lipoprotein RlpB  38.69 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00131027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1556  rare lipoprotein B  33.73 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.22375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1190  rare lipoprotein B  31.21 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  32.05 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  29.61 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  29.61 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  25.13 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  30.63 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  25.67 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  36.19 
 
 		 208 aa  51.2  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  27.16 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  32.32 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  26.39 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  28.93 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  29.33 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  32.61 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  34.34 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  29.22 
 
 		 201 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  28.4 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  33.33 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  27.45 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  33.33 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  32.32 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  25.64 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  27.27 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>