14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003212 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003212  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  276  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003298  hypothetical protein  90.98 
 
 
133 aa  259  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06435  hypothetical protein  78.52 
 
 
135 aa  217  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0026  hypothetical protein  68.42 
 
 
134 aa  197  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1278  hypothetical protein  45.8 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1907  hypothetical protein  34.92 
 
 
234 aa  84.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.469149  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0799  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0813  hypothetical protein  38.64 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0658  hypothetical protein  31.06 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.815459  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2430  hypothetical protein  43.75 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4334  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00241098  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05385  hypothetical protein  31.11 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0650384  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1018  hypothetical protein  36.51 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.492619  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4137  hypothetical protein  31.43 
 
 
205 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0700051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>