23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1923 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002635  hypothetical protein  59 
 
 		 782 aa  1001    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.729255  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0625  hypothetical protein  43.33 
 
 		 781 aa  704    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.432521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03371  hypothetical protein  59.67 
 
 		 782 aa  1019    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1923  hypothetical protein  100 
 
 		 779 aa  1609    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.453342  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3221  type IV pilus assembly PilZ  28.5 
 
 		 793 aa  290  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3359  type IV pilus assembly PilZ  28.37 
 
 		 793 aa  287  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1147  type IV pilus assembly PilZ  28.12 
 
 		 793 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1048  type IV pilus assembly PilZ  27.63 
 
 		 790 aa  279  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.023963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1279  type IV pilus assembly PilZ  27.37 
 
 		 840 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1044  type IV pilus assembly PilZ  27.49 
 
 		 790 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.713733  hitchhiker  0.00851048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2815  type IV pilus assembly PilZ  27.69 
 
 		 795 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1109  type IV pilus assembly PilZ  27.49 
 
 		 790 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.618893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1225  hypothetical protein  27.05 
 
 		 792 aa  266  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2808  type IV pilus assembly PilZ  26.83 
 
 		 796 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000659651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3371  type IV pilus assembly PilZ  26.6 
 
 		 804 aa  259  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3220  type IV pilus assembly PilZ  26.46 
 
 		 804 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1034  type IV pilus assembly PilZ  26.57 
 
 		 796 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0980  hypothetical protein  25.85 
 
 		 792 aa  255  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.218662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3541  type IV pilus assembly PilZ  26.39 
 
 		 805 aa  250  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0300151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3033  type IV pilus assembly PilZ  25.4 
 
 		 805 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02992  type IV pilus assembly PilZ  24.63 
 
 		 841 aa  235  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.488872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1106  hypothetical protein  25.49 
 
 		 822 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1009  type IV pilus assembly PilZ  25.19 
 
 		 794 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>