23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1797 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1797  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  289  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004178  flagellar biosynthesis protein FlgN  67.38 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01279  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway chaperone  65.25 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2343  polar flagellar FlgN, putative chaperone  60.87 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.312185  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3092  FlgN family protein  31.91 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1335  FlgN family protein  32.62 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1340  FlgN family protein  30.5 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1298  FlgN  31.91 
 
 		 141 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1592  FlgN family protein  30.5 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.89295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1156  FlgN family protein  30.4 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2323  flagellar biosynthetic protein FlgN  34.29 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.697168  normal  0.220477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2602  FlgN family protein  27.35 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.813191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3105  FlgN family protein  26.95 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2967  FlgN family protein  26.95 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2952  FlgN family protein  26.95 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.409825  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1324  FlgN family protein  27.35 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1254  FlgN family protein  27.35 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1471  putative flagellar protein FlgN  31.31 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1411  FlgN family protein  26.24 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3255  flagellar biosynthetic protein FlgN  28.21 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1316  FlgN family protein  26.5 
 
 		 141 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02935  putative flagellar protein FlgN  30.4 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.493772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3105  FlgN  26.15 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>