79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1471 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  360  8e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  83.83 
 
 		 169 aa  301  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  83.23 
 
 		 169 aa  300  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  83.73 
 
 		 174 aa  299  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  57.23 
 
 		 169 aa  217  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  57.99 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  58.68 
 
 		 167 aa  214  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  57.14 
 
 		 169 aa  209  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  56.55 
 
 		 168 aa  207  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  53.89 
 
 		 174 aa  207  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  54.44 
 
 		 169 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  54.44 
 
 		 169 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  54.49 
 
 		 169 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  54.44 
 
 		 169 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  57.23 
 
 		 168 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  55.03 
 
 		 169 aa  205  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  55.03 
 
 		 169 aa  203  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  55.03 
 
 		 169 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  55.03 
 
 		 169 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  55.03 
 
 		 169 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  54.49 
 
 		 169 aa  200  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  51.81 
 
 		 168 aa  193  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  51.81 
 
 		 169 aa  188  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  52.44 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  51.83 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  51.57 
 
 		 159 aa  181  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  48.82 
 
 		 172 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  48.5 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  49.1 
 
 		 212 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  49.69 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  45.29 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  47.56 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  47.93 
 
 		 175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  41.81 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  44.25 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  44.31 
 
 		 171 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  47.2 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  47.06 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  44 
 
 		 198 aa  151  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  44.74 
 
 		 163 aa  150  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  46.62 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  44.23 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  39.08 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  32.24 
 
 		 197 aa  106  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  31.02 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  34.48 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  35.43 
 
 		 198 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  36.2 
 
 		 178 aa  98.2  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  29.82 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  32.14 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  27.61 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  33.54 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  30.91 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  27.16 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  43.24 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  33.94 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  29.1 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  26.06 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  33.08 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  24.86 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  30.47 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  31.34 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  29.82 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  31.19 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  30.28 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  29.63 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  28.06 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  28.86 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  25.15 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  29.3 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  24.68 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  24.68 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  28.3 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  27.41 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  27.36 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  28 
 
 		 190 aa  42  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  28 
 
 		 190 aa  42  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>