24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1121 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1121  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003495  hypothetical protein  65.15 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02276  hypothetical protein  65.15 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3723  twin-arginine translocation pathway signal  44.62 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3794  twin-arginine translocation pathway signal  44.62 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3919  hypothetical protein  44.62 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4109  formate dehydrogenase region TAT target  41.27 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0230  formate dehydrogenase region TAT target  41.27 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4227  formate dehydrogenase region TAT target  41.27 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0062  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4139  hypothetical protein  41.27 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4418  hypothetical protein  48.53 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4810  formate dehydrogenase region TAT target  47.06 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.202852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0334  twin-arginine translocation pathway signal  44.62 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4134  formate dehydrogenase region TAT target  52.24 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4130  formate dehydrogenase region TAT target  48.53 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4223  formate dehydrogenase region TAT target  50.91 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235438 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0234  formate dehydrogenase region TAT target  50.91 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1452  hypothetical protein  50.82 
 
 		 65 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4105  formate dehydrogenase region TAT target  49.09 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4135  hypothetical protein  49.09 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4508  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3915  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4512  hypothetical protein  47.69 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>