20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0742 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0695  phage protein GP46  100 
 
 		 149 aa  299  9e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0742  phage protein GP46  100 
 
 		 149 aa  299  9e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2701  hypothetical protein  67.79 
 
 		 151 aa  207  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1045  phage protein GP46  47.27 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2812  GP46 family protein  37.31 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1472  phage protein GP46  37.31 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2734  phage protein GP46  37.31 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.86914  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3114  GP46 family protein  40.52 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2085  phage protein GP46  44.04 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1871  GP46 family protein  44.76 
 
 		 405 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881976  hitchhiker  0.000000000000640584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3048  putative bacteriophage protein GP46, Mu-like  43.27 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3734  phage GP46  35.66 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2585  phage GP46 family protein  36.79 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2249  phage protein GP46  36.07 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4480  phage protein GP46  36.07 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2252  phage protein GP46  36.07 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4483  GP46 family protein  35.87 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.185083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2445  hypothetical protein  32.14 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3861  phage FluMu protein gp46  34.65 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1161  Phage FluMu protein gp46  38.82 
 
 		 132 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>