32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1032 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1120    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  46.29 
 
 		 541 aa  444  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  37.1 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  35.56 
 
 		 567 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  35.74 
 
 		 567 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  35.74 
 
 		 567 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  35.9 
 
 		 565 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  36.5 
 
 		 323 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  35.89 
 
 		 323 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  33.54 
 
 		 321 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  38.33 
 
 		 359 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  35.14 
 
 		 360 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  38.71 
 
 		 359 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  30.35 
 
 		 364 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0742  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.10229 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1304  hypothetical protein  31.11 
 
 		 230 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0565  hypothetical protein  34.63 
 
 		 230 aa  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.465028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0681  hypothetical protein  31.88 
 
 		 232 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5075  hypothetical protein  32.31 
 
 		 230 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05048  hypothetical protein  28.76 
 
 		 229 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  35.77 
 
 		 178 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0721  hypothetical protein  32 
 
 		 225 aa  134  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2744  hypothetical protein  31.39 
 
 		 228 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.950913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1447  hypothetical protein  30.94 
 
 		 228 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0262  hypothetical protein  32.21 
 
 		 233 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  36.36 
 
 		 232 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4921  hypothetical protein  40.98 
 
 		 125 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  38.78 
 
 		 231 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4920  hypothetical protein  32.34 
 
 		 197 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  30.13 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3389  baseplate assembly protein, putative  26.15 
 
 		 240 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1301  baseplate assembly protein, putative  24.68 
 
 		 241 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>