15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0975 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0975  hypothetical protein  100 
 
 
743 aa  1535    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3046  hypothetical protein  44.81 
 
 
727 aa  606  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2055  putative lipoprotein  28.3 
 
 
768 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.494297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2077  putative lipoprotein  27.56 
 
 
765 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000185835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1837  putative lipoprotein  27.96 
 
 
767 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.728025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3353  hypothetical protein  29.39 
 
 
767 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000362866  hitchhiker  0.0000000000000504435 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1803  lipoprotein  26.93 
 
 
765 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1786  lipoprotein  26.37 
 
 
765 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1974  hypothetical protein  29.85 
 
 
767 aa  281  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1829  putative lipoprotein  28.27 
 
 
765 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1972  putative lipoprotein  28.27 
 
 
765 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2006  putative lipoprotein  26.67 
 
 
765 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.79084e-41 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0314  hypothetical protein  28.96 
 
 
767 aa  236  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0976  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0564  hypothetical protein  22.22 
 
 
631 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.183878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>