Gene UUR10_0460 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagUUR10_0460 
SymboldnaE 
ID6983722 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameUreaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_011374 
Strand
Start bp510502 
End bp513411 
Gene Length2910 bp 
Protein Length969 aa 
Translation table
GC content24% 
IMG OID643400032 
ProductDNA polymerase III DnaE 
Protein accessionYP_002284852 
Protein GI209554072 
COG category[L] Replication, recombination and repair 
COG ID[COG0587] DNA polymerase III, alpha subunit 
TIGRFAM ID[TIGR00594] DNA-directed DNA polymerase III (polc)
[TIGR01435] glutamate--cysteine ligase/gamma-glutamylcysteine synthetase, Streptococcus agalactiae type 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones11 
Plasmid unclonability p-value
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clonesn/a 
Fosmid unclonability p-valuen/a 
Fosmid Hitchhikern/a 
Fosmid clonabilityn/a 
 

Sequence

Gene sequence
ATGTTTATTA ATTTAAATGT GCACTCATAT TATTCTTTAC TTAATAGCGC TTTAAGTATT 
GATGATTTAA TTCAACACGC ATTAGATAAT AATCAACCAT ATGTTTGTTT AACAGATTTA
AATAACATGT ATGGTTGTAT TGAATTTTAT GATAAAGCGA AAGCACATAA TTTAATTCCC
ATCATTGGTT TAGAATTTGA ATATCAAAAC ACAACTTTAG TAGCTTATGC TAAAAATTAT
AATGGCTATT TAAAATTAAT TAAATGATCA TCTTGAATTA TGACAAATAC AACATTTATA
ATTCAAGAAG ATTTTGATGA TTTAATTATT GTTTGTAAAA AAGGGGGTTT AGTTTTTGAA
AACCCTAATT TTTATCAAGC CCAAAATCAA AACGCTTCTA ATGCTATTGC ATTACAAAGC
GTTTTTTATG CACAAGAAAA TGATAAAACA GTTTTTTTAG CCATGCTTGC TATTAAAAAT
GATTTAAAAT TAGATGATTT TATAGATTGT CATGAATTTG ATAAAAATTA TTTTTTAAAT
GATCATGAAG CACAATCTTT ATTTTCAACA ATTGCTTTAG ATAATTTAAA TAAAGTTTTA
AATGAATTAC AAGTTGAAAT TCATGATCTA CCAATTAATA TTCCTGTTTA TGATAAAAAC
AATTTAACAG TTTCGAGTGA AATTTTAAAA CAATTGTGTA TTAGTGGATT AAAACAACGT
TTAAACGCTC ATGATGGGCA AGTTAAAAAA GTTTATGCTA AACGGTTAAA ATATGAGTTA
GATGTTATTA GTGAAAAACA ATTTGATGAT TATTTTTTAA TTGTTTATGA TTTTATAAAT
TATGCTAAAA GCAATGGAAT TATTGTAGGA CCTGGTCGAG GAAGTGCAGC TGGGTCATTA
GTTGCGTATT GTTTGTATAT TACTGATATT GATCCCATTA AACATAATTT AATCTTTGAA
CGATTTTTAA ATCCAACAAG AAAAAGTATG CCAGATATTG ATACTGACAT TATGGATGAA
AAACGTGATC AAGTCATTGA ATATTTATTT GAAAAATATG GCAATGATCA CGTTGCTTAT
ATTGTAACTT TTCAACGATT AAAAGCAAAA ATGGCCCTTC GTGATGTGGG GCGGATTTTG
GGTATTGATT TAAAAGTCAT TGATAAAATT TGCAAAAACA TTAAAACTGA TTATGATGAA
GACATTGATT TAGCAATTAA AAAAAGTGCG ACATTAAAAG AAATGTATGT TTTACATAAA
GAATTATTTG AAATTTCTAA AAAATTAATT CATGCTCCAC GTCAAATTGG AACACATGCT
GCTGGAATAA TTTTAAGCAA TAGTTCAATT ACAAATATTA TTCCAATTCA ATTAGGCATT
AATGATCGTC CTTTATCACA ATATTCAATG GAGTATTTAG AACGTTTTGG TTTAATTAAA
ATGGATTTAT TAGGTTTAAA AAACCTAACA ATTATTGATA ATGTTTTAAA AATGATTTAT
AAAACACAAA ATAAAAAAAT CGATCTTTTT AATATTGATT ACAATGATAA ATTTGTTTTT
CAAGATTTAG CAAAAGCTAA AACAAATGGT ATTTTTCAAT TAGAATCACC TGGAATGAAA
AAGGTTTTAT TAAAAGTTAA GCCACAAAAT ATTGAAGATA TTTCCATTGT TTCAGCACTT
TTTAGACCAG GTCCACAACA AAATATTAAA ACATTTGTTG AACGACGATT CAAACGTGAA
GAATTTAGTT ATTGAAATGA ACAAACAAAA AAAATTTTAG AACCAACATA TGGAATAATT
ATTTATCAAG AACAAGTGAT TGAATTAGTT AAAACAATTG CTAATTTTGA TATTGCAACA
TCTGATAATT TCCGTCGAGC AATTTCAAAA AAAGATGAAA AAATTTTAAT GCAACTAAAA
GATGATTTTA TTAATGGTGC TTTAGCTAAT AATTATAAAC AACCATTAGT AAACCAAATT
TTTGAATATA TTTTCTCATT TGCTCATTAT GGATTTAACC ATTCTCACTC ACTAGCATAT
TCATACATTA GTTATTGATT AGCTTATTTA AAACATTATT ATCCACTAGA ATTTTTAAGT
GTTTTACTAT CACATACGAG TGCATCAAAA GAAAAACTAT TATCTTATTT AGATGAAACT
AAAGATTTTA ATATTAGTAT TAAAGGACCT GATATTCAAC ATTTTAGTAA TGATTTTGTC
ATTGATAATC ACAAACAAAT TATTCGTTTT GGTTTTAAAA CAATTAAAGG TTTTGGTGAT
GAGTTACTTA AAAAAATTAA GTTAGCTTTA GAAAATGCAG AATTAAGTGA TTATATTTCA
TATATTGATG CTTTAAAAAA AGGTAACATT AGTTTAAAAA ATATTGAAAT TTTAATTCGC
ATTGGAGCTT TTGATAGCTT TGAAATTAAT CGTTTATTTT TATTAAATAA TTTAGAAGAA
ATTTTTGAGA AAACAGGATT GAATGGTCAT TTTTTTGATT TAAATTTAGT TGGTTTAGAT
TATGCAAATG ATATGAGTAT TAATGAACGT TTTCAAGAAG ATGAAATTCA ATATTTAGGA
ATTAATTTAA GTAGTTTAAA TTACACAAAT TATACTAATG AAATTGATTA TAGCAATTTA
AAATATGAAA TTGAAAGTTT TAATGAAATC AATACAAATT ATGAAGTAAA TATTGTAGCT
CAAGTTTTAA ATATCGTGCA ATCAAAAACT AAAAAAGGTA ATGATATTTT TTATTTGGAT
GTACTAGTTG AAAACAAAAA AGAAAAATTA ACAATTTTTC AAAATAGTAA GCATTTAGTT
GATGAAATTG ACATTAATGG AATTTATGTT TTTGGTGTTA AATTATTAAA TCATTTTAAT
TTTATTGTAA GTGTTAAACA AAGGGTCTAG
 
Protein sequence
MFINLNVHSY YSLLNSALSI DDLIQHALDN NQPYVCLTDL NNMYGCIEFY DKAKAHNLIP 
IIGLEFEYQN TTLVAYAKNY NGYLKLIKWS SWIMTNTTFI IQEDFDDLII VCKKGGLVFE
NPNFYQAQNQ NASNAIALQS VFYAQENDKT VFLAMLAIKN DLKLDDFIDC HEFDKNYFLN
DHEAQSLFST IALDNLNKVL NELQVEIHDL PINIPVYDKN NLTVSSEILK QLCISGLKQR
LNAHDGQVKK VYAKRLKYEL DVISEKQFDD YFLIVYDFIN YAKSNGIIVG PGRGSAAGSL
VAYCLYITDI DPIKHNLIFE RFLNPTRKSM PDIDTDIMDE KRDQVIEYLF EKYGNDHVAY
IVTFQRLKAK MALRDVGRIL GIDLKVIDKI CKNIKTDYDE DIDLAIKKSA TLKEMYVLHK
ELFEISKKLI HAPRQIGTHA AGIILSNSSI TNIIPIQLGI NDRPLSQYSM EYLERFGLIK
MDLLGLKNLT IIDNVLKMIY KTQNKKIDLF NIDYNDKFVF QDLAKAKTNG IFQLESPGMK
KVLLKVKPQN IEDISIVSAL FRPGPQQNIK TFVERRFKRE EFSYWNEQTK KILEPTYGII
IYQEQVIELV KTIANFDIAT SDNFRRAISK KDEKILMQLK DDFINGALAN NYKQPLVNQI
FEYIFSFAHY GFNHSHSLAY SYISYWLAYL KHYYPLEFLS VLLSHTSASK EKLLSYLDET
KDFNISIKGP DIQHFSNDFV IDNHKQIIRF GFKTIKGFGD ELLKKIKLAL ENAELSDYIS
YIDALKKGNI SLKNIEILIR IGAFDSFEIN RLFLLNNLEE IFEKTGLNGH FFDLNLVGLD
YANDMSINER FQEDEIQYLG INLSSLNYTN YTNEIDYSNL KYEIESFNEI NTNYEVNIVA
QVLNIVQSKT KKGNDIFYLD VLVENKKEKL TIFQNSKHLV DEIDINGIYV FGVKLLNHFN
FIVSVKQRV