12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0886 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0886  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  392  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0727  hypothetical protein  42.24 
 
 
123 aa  100  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1938  hypothetical protein  39.83 
 
 
124 aa  96.7  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.498106  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2296  hypothetical protein  40.54 
 
 
124 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.725623  normal  0.0111522 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0943  hypothetical protein  35.71 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0868484 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2068  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0324  hypothetical protein  34.39 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0819  hypothetical protein  33.87 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.737559 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1067  hypothetical protein  33.51 
 
 
187 aa  72  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.585968 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1342  hypothetical protein  35.85 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0212  protein of unknown function DUF437  34.65 
 
 
106 aa  59.3  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2390  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  25 
 
 
249 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>