18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0560 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0560  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  100 
 
 		 123 aa  246  6e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1510  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  41 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0219546  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1272  putative ribonuclease P subunit RPR2  39.81 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0214  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  34.69 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125403  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1889  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  36.36 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.475377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3013  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.35 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1734  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  37.5 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0728  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  36.46 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.154027  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0168  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  34.04 
 
 		 110 aa  57  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.736645 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0421  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.64 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0089  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  36.96 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1485  hypothetical protein  34.38 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000525267  hitchhiker  0.00254885 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1975  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  37.5 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.813085  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0533  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.38 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000671955  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0671  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  24.75 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0746  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.95 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0240663  normal  0.0930395 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.48 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.99 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>