29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0448 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  100 
 
 		 106 aa  213  5e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  39.77 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1410  SSU ribosomal protein S24E (rps24E)  43.21 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  43.62 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  43.33 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  39.78 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  36.56 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  33.33 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  38.2 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  33.68 
 
 		 99 aa  60.1  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  29.7 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21323  predicted protein  31.46 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  32.97 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0004  ribosomal protein S24E-like protein  30.61 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  28.16 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09097  37S ribosomal protein S24 (AFU_orthologue; AFUA_7G02140)  29.89 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133794  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  29.67 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  28.12 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  29.67 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42986  Ribosomal protein S24, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  30.11 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127832  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_006686  CND04480  structural constituent of ribosome, putative  32.98 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.287785  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  28.43 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  29.67 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87922  ribosomal protein S24  29.89 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  29.67 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  29.67 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  28.42 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  29.67 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  32.93 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>