18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4225 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  100 
 
 		 831 aa  1620    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4842  hypothetical protein  40.93 
 
 		 905 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5399  hypothetical protein  41.06 
 
 		 809 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5488  hypothetical protein  41.06 
 
 		 809 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5775  hypothetical protein  41.06 
 
 		 809 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551065  normal  0.325529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6063  hypothetical protein  40.44 
 
 		 811 aa  465  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.405388  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  40.95 
 
 		 804 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  41.24 
 
 		 802 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  31.67 
 
 		 764 aa  238  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  28.66 
 
 		 706 aa  207  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  33.06 
 
 		 873 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  33.87 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  24.45 
 
 		 713 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  32.18 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  27.48 
 
 		 814 aa  52.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  30.91 
 
 		 884 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9037  hypothetical protein  25.14 
 
 		 718 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  31.79 
 
 		 706 aa  45.8  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>