44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3106 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3106  protein of unknown function DUF466  100 
 
 		 66 aa  137  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2309  protein of unknown function DUF466  53.45 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163671  hitchhiker  0.00083492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1778  hypothetical protein  66.67 
 
 		 45 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.380449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1844  hypothetical protein  66.67 
 
 		 45 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.598922  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1797  hypothetical protein  66.67 
 
 		 45 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3362  protein of unknown function DUF466  45 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.280192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16570  uncharacterized small protein  43.33 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15000  hypothetical protein  41.94 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344355  normal  0.519615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2023  hypothetical protein  53.33 
 
 		 45 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1573  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.197269  normal  0.788025 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08620  uncharacterized small protein  41.18 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0335  protein of unknown function DUF466  46.94 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4323  hypothetical protein  53.33 
 
 		 45 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.619207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4227  hypothetical protein  36.76 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0260  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2450  hypothetical protein  41.67 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.974408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1939  protein of unknown function DUF466  38.33 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294211  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2938  hypothetical protein  41.3 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.888037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0682  hypothetical protein  31.67 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.643858  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1978  protein of unknown function DUF466  40.82 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89356  normal  0.275642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0421  hypothetical protein  39.29 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.849917  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3064  hypothetical protein  41.3 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2016  hypothetical protein  38.78 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1293  hypothetical protein  45 
 
 		 785 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2293  protein of unknown function DUF466  38.78 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2251  hypothetical protein  39.13 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284192  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0654  hypothetical protein  34.43 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0713  hypothetical protein  34.43 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.885775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0759  hypothetical protein  34.43 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0640  hypothetical protein  34.43 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0697  hypothetical protein  34.43 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0939603 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1187  protein of unknown function DUF466  32.26 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00439042  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1364  protein of unknown function DUF466  42.86 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.208955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1024  hypothetical protein  39.13 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0501  hypothetical protein  32.79 
 
 		 65 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00555  hypothetical protein  32.79 
 
 		 65 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0684  hypothetical protein  32.79 
 
 		 65 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00566  hypothetical protein  32.79 
 
 		 65 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.559075  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0619  hypothetical protein  32.79 
 
 		 65 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.593991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3045  hypothetical protein  32.79 
 
 		 65 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0619  hypothetical protein  32.79 
 
 		 65 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0650  hypothetical protein  32.79 
 
 		 65 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3026  protein of unknown function DUF466  32.79 
 
 		 65 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>