14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1389 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1389  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  326  8e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1132  hypothetical protein  46.21 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0544737  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5604  hypothetical protein  39.22 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0168557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1749  hypothetical protein  38.31 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.766751  hitchhiker  0.00905624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3893  hypothetical protein  36.94 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3295  hypothetical protein  37.42 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0447  hypothetical protein  35.76 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2398  hypothetical protein  37.42 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000409685  decreased coverage  0.000121837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2969  hypothetical protein  29.41 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1228  hypothetical protein  34.23 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.400134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1099  hypothetical protein  32.89 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1033  hypothetical protein  29.73 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3333  hypothetical protein  33.81 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3850  hypothetical protein  30.92 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0802919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>