15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0151 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0151  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  494  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  25 
 
 
232 aa  58.9  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1018  hypothetical protein  33.9 
 
 
171 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333587  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2522  hypothetical protein  35 
 
 
348 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3135  hypothetical protein  35 
 
 
348 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3151  hypothetical protein  35 
 
 
301 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1248  hypothetical protein  34.65 
 
 
266 aa  52.4  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  23.6 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3132  hypothetical protein  32.74 
 
 
350 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880988  hitchhiker  0.00102312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2089  hypothetical protein  31.3 
 
 
356 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.103508  normal  0.0386163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6486  hypothetical protein  33.94 
 
 
301 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3961  hypothetical protein  32.67 
 
 
155 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2145  hypothetical protein  32.04 
 
 
204 aa  45.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2873  hypothetical protein  25.34 
 
 
233 aa  45.4  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3627  hypothetical protein  32.46 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.805945  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>