48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3492 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3492  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3556  hypothetical protein  55.78 
 
 
190 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3393  hypothetical protein  51.01 
 
 
184 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191739  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1829  hypothetical protein  47.83 
 
 
203 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1562  hypothetical protein  47.33 
 
 
213 aa  151  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0703  hypothetical protein  44.94 
 
 
204 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00895458  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1843  hypothetical protein  46.36 
 
 
192 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5028  putative lipoprotein  39.35 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4472  putative lipoprotein  41.33 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0680  lipoprotein, putative  41.33 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3866  hypothetical protein  39.74 
 
 
173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0142  hypothetical protein  37.97 
 
 
153 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.143516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0505  putative lipoprotein  34.12 
 
 
212 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0127462  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0305  hypothetical protein  33.14 
 
 
193 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0550  lipoprotein  38.82 
 
 
190 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.916886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1814  hypothetical protein  34.76 
 
 
189 aa  104  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0558  lipoprotein  38.12 
 
 
171 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  0.717571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0540  hypothetical protein  37.5 
 
 
177 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3430  hypothetical protein  38.71 
 
 
171 aa  101  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00217  lipoprotein, putative  38.36 
 
 
158 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0425  hypothetical protein  35.95 
 
 
161 aa  99  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11280  hypothetical protein  37.33 
 
 
172 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1036  hypothetical protein  37.33 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06620  hypothetical protein  37.01 
 
 
171 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2133  hypothetical protein  35.37 
 
 
173 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1973  hypothetical protein  29.37 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00771  hypothetical protein  32.92 
 
 
164 aa  89.4  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2156  hypothetical protein  31.61 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.811392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001702  hypothetical protein  43.75 
 
 
164 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01230  hypothetical protein  42.06 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3621  hypothetical protein  41.49 
 
 
151 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5045  hypothetical protein  40 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.110017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5491  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0303  hypothetical protein  31.2 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.965134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3013  hypothetical protein  32.61 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.195597  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2285  hypothetical protein  32.08 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0141  hypothetical protein  42.55 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5619  hypothetical protein  41.49 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774523  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71580  hypothetical protein  36.89 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0115  hypothetical protein  31.93 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4181  hypothetical protein  38.95 
 
 
155 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6211  hypothetical protein  37.5 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05705  hypothetical protein  32.64 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2155  hypothetical protein  40 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4728  hypothetical protein  31.58 
 
 
185 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5241  hypothetical protein  41.25 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98466  normal  0.106495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5333  hypothetical protein  41.25 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5382  hypothetical protein  41.25 
 
 
177 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.246443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>