16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3160 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3160  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  787    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1057  hypothetical protein  30.1 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3242  hypothetical protein  31.25 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1789  hypothetical protein  26.11 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0235  hypothetical protein  58.33 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5348  hypothetical protein  48.44 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1418  hypothetical protein  27.92 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1186  hypothetical protein  23.09 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3225  hypothetical protein  23.61 
 
 
268 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5084  hypothetical protein  49.15 
 
 
229 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000765562  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3285  hypothetical protein  31.37 
 
 
299 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6294  hypothetical protein  45.45 
 
 
455 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2360  hypothetical protein  39.34 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2209  hypothetical protein  28.97 
 
 
567 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.706281  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6291  hypothetical protein  24.12 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5498  hypothetical protein  23.53 
 
 
485 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0138442  normal  0.0382581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>